Uvedeným obcím hrozí, že od příštího roku nezískají nové povolení na vypouštění odpadních vod. Problém se týká asi tisícovky obcí z celé ČR. Nebudou totiž schopny dodržet limity znečištění stanovené nařízením vlády. Platnost dosavadních povolení vydaných do konce roku 2001 jim skončí v závěru letošního roku. Odpůrci argumentují mimo jiné tím, že obce měly možnost do konce roku 2002 požádat o výjimku a ta by platila deset let.
Odpůrcům také vadilo, že návrh novelizuje přechodná ustanovení. Navíc by prý byl demotivační vůči obcím, které již problém začaly řešit samy a shánějí peníze na stavbu čističek. Poslanec Václav Mencl (ODS) při projednávání v druhém čtení poslance informoval, že ministerstvo životního prostředí bude bude při úvahách o sankcích přihlížet k tomu, zda už začaly situaci řešit.