S návrhem na omezení dotací nesouhlasí mlékárny ani Agrární komora ČR. Některé mlékárny pohrozily, že v případě ukončení programu budou po státu požadovat náhradu škody. "V případě zrušení programu budou pravděpodobně následovat soudní žaloby o náhradu škody. A protože se jedná v některých případech i o zahraniční vlastníky, není vyloučena ani mezinárodní arbitráž," uvedl již dříve šéf Českomoravského svazu mlékárenského Michal Němec. Mlékárny podle něj kvůli tomuto projektu investovaly zhruba 100 milionů korun a školy například vybavily automaty na mléko či lednicemi.
Podnětem k ukončení národní podpory školního mléka je hledání úspor v rozpočtu Ministerstva zemědělství ČR. Důvodem jsou škrty ve státním rozpočtu pro resort, ministerstvo musí ušetřit takřka pět miliard korun.
Národní podpora, která byla doposud poskytována u běžné distribuce, představovala v průměru 32 procent z celkových nákladů výrobku. Její zrušení předpokládá roční finanční úsporu ve výši dosahující zhruba 60 milionů korun.
"Ceny mléčných výrobků v rámci programu budou nadále nižší než tržní. Zůstává zachována dotace EU, příznivou finální částku tvoří i nižší výrobní cena bez marže oproti úrovni běžné v obchodech. Cena mléčného výrobku tak zůstane zvýhodněná i po zrušení národní podpory," uvedl ministr zemědělství Petr Gandalovič.