Se stavbou tunelu nesouhlasí Auto*Mat a dalších sedm nevládních organizací. "Záměr dostavby magistrály je bezprecedentním případem ekonomické neefektivity," píší v dopise ministrům. Město by se podle nich mělo spíše zasadit o celkové zklidnění dopravy a přeměnu magistrály na městský bulvár. Investici si podle nevládních organizací zaslouží jiné dopravní projekty, třeba metro.
Magistrála patří k největším dopravním problémům hlavního města. Hustý provoz obtěžuje okolní obyvatele hlukem a prachem, urbanisté navíc kritizují faktické odříznutí Vinohradské ulice a Národního muzea od Václavského náměstí.
Pokud ekonomičtí ministři záměr schválí, bude se jím zabývat vláda.