Nově na ministerstvu vzniká úsek pro Společnou zemědělskou a rybářskou politiku. V jeho čele bude stát Juraj Chmiel, který byl ve Fischerově vládě ministrem pro evropské záležitosti.
Ve vedení komoditního úseku končí jeho dlouholetý šéf Stanislav Kozák (dříve KDU-ČSL, dnes TOP 09), nahradí jej jeho spolustraník Karel Tureček, dosavadní statutární náměstek ministra. Z místa náměstka pro životní prostředí, výzkum a vzdělávání odchází Jiří Urban (Strana zelených). Zároveň přestává existovat jím dosud vedený úsek, jehož agenda se rozdělí mezi jiné sekce.
Ekonomický úsek povede i nadále Oldřich Černoch, vodní hospodářství bude mít i nadále na starosti Aleš Kendík. Náměstkem pro úsek lesního hospodářství zůstává Jiří Novák.
Boček bude mít na starosti správu úřadu. Spadat pod něj bude například odbor zakladatelské činnosti, informačních a komunikačních technologií nebo registry.