Dále by měla omezit daňové úniky podle ministra i restrukturalizace daňové správy. Celkem 199 finančních úřadů by mělo nahradit 14 finančních úřadů s krajskou působností. Zbylé úřady se stanou pouze pracovišti, které bude moci přesouvat podle potřeby. Zároveň vznikne specializovaný daňový úřad pro firmy s obratem nad dvě miliardy korun.
Tuzemských specifikem v případě daňových úniků je podle ředitele Generálního finančního ředitelství Jana Knížka jsou daňové úniky u pohonných hmot. Ředitelství podle něj podniká ve spolupráci s celní správou a Finančně analytickým útvarem MF celorepublikové kontrolní akce.
V rámci těchto akcí daňová správa v případě pohonných hmot od roku 2009 do dneška doměřila na daních celkem 11,6 miliardy korun a podala 46 trestních oznámení. V uvedeném období přitom bylo provedena daňová kontrola 371 subjektů.
V rámci legislativy kolem DPH chce Generální finanční ředitelství zavést ve speciálních případech okamžitou vykonatelnost tzv. zajišťovacího příkazu, kterým se zablokují peníze na účtu daného podniku. "Umožní to včasné zajištění daňového úniku u subjektu v okamžiku, kdy ještě disponuje finančními prostředky. Dnes příkaz platí od data doručení," uvedl Knížek.
Finančně analytický útvaru MF, který je primárně zaměřen na boj proti praní špinavých peněz, se podle jeho šéfa Milana Cícera setkává rovněž s případy daňových úniků. Počet předaných případů podle něj zvýšil ze 135 v roce 2008 na 639 v roce 2010. "Za první čtyři měsíce roku 2011 pak toto číslo činí 448 případů," uvedl Cícer.