Podle NKÚ ministerstvo financí nepožadovalo důsledné plnění povinností kontaktních míst, která se podílela na výběru doporučených projektů. "Výdej peněžních prostředků uskutečněný v důsledku tohoto pochybení...je porušením rozpočtové kázně a současně také nesrovnalostí," uvádí zpráva NKÚ.
Nedostatky byly na MF zjištěny i v obecném nastavení kontrol. Při ověřování systému hlášení a šetření nesrovnalostí zjistil NKÚ několik případů nedodržení předepsaných postupů. MF v několika případech samo požadovalo vrácení částky vyčíslené jako nesrovnalost na účet vratek, ačkoliv k tomu neexistovalo zákonné zmocnění. V této oblasti upozornil NKÚ na nedostatečnou právní úpravu.
Kontrola dále prověřila činnosti zprostředkovatelů a postup ministerstva kultury při zprostředkování financování projektů jím zřízených příspěvkových organizací. "Ačkoliv ministerstvo kultury samo doporučilo zrušit několik smluv z důvodu pochybení při výběru dodavatelů, schválilo později proplacení výdajů, které na základě těchto smluv vznikly," uvedl NKÚ. Kritizoval i nedostatečnou kontrolu výdajů.
Kontrola se uskutečnila od listopadu 2010 do října 2011. Kontrolovaným obdobím byly roky 2007 až 2010, v případě věcných souvislostí i období předcházející a následující.