"Byly zvažovány i možnosti zřízení FAÚ jako samostatného úřadu podřízeného pouze vládě, případně jako samostatného úřadu v rámci ministerstva financí, ale konečný efekt takových řešení by nebyl adekvátní nákladům, které by s tím byly spojeny," uvádí MF v důvodové zprávě. Zároveň dodalo, že snahou zákona je i vyloučit možnost politického zneužití úřadu.
V případě podávání informací vládě a poslancům by podle návrhu neměly zprávy obsahovat osobní údaje šetřených osob a neměly by se týkat případů, v nichž FAÚ dosud neukončil šetření.
FAÚ shromažďuje například informace o podezřelých transakcích a spolupracuje s policií. Finanční analytický útvar předloni zajistil přes 808 milionů korun. O rok dříve to bylo 287 milionů korun. Útvar v roce 2011 podal 256 trestních oznámení.
Útvar je součástí celosvětové sítě takzvaných finančních zpravodajských jednotek zřízených pro boj proti praní špinavých peněz a financování terorismu. Vedle toho je i koordinátorem uplatňování mezinárodních sankcí.
FAÚ předloni například zjišťoval toky peněz od firmy Promopro, která v době českého předsednictví EU zajišťovala pro stát zakázku na audiovizuální služby.