Chybou bylo podle Eura například to, že výběrová komise při konečném posouzení dostatečně neodůvodnila své hodnocení technických parametrů nabízených aplikací, čímž se volba stala netransparentní. Předvedení softwaru si vyžádala až dodatečně, aniž by se o něm zmínila v zadání otevřeného řízení, což je povinností zadavatele.
ÚOHS nařídil ministerstvu zrušit výsledek výběrového řízení a zhodnotit nabídky znovu. Úřad se problémem zabýval poté, co se k němu odvolala společnost SAP, která v tendru skončila druhá. Ta nejprve v červnu podala námitku proti rozhodnutí ministerstva, ale neuspěla.
Nabídky v březnu podaly celkem čtyři subjekty - konsorcium vedené švédskou Tremou, německá společnost SAP, česká Gordic a firma Siemens Business Services společně s IBM. Všechny společnosti požadovaly za vybudování informačního systému více než 40 milionů korun, výjimkou byl SAP, který chtěl částku o polovinu nižší. Cena nicméně hrála při hodnocení menší roli než funkční a technické požadavky na systém.