Jukos byl největší ruskou ropnou společností ještě v roce 2004, tehdy však proti němu ruské úřady vznesly požadavek zaplatit na daňových nedoplatcích více než 30 miliard dolarů. Úřady na konci roku 2004 Jukosu zkonfiskovaly a prodaly největší těžební divizi Juganskněftěgaz.
Útok úřadů proti Jukosu navazoval na obvinění a odsouzení bývalého šéfa firmy Michaila Chodorkovského za privatizační podvody a daňové úniky. Firma pokládá daňové nároky státu za součást kampaně, v níž chce Kreml potrestat Chodorkovského za jeho politické aktivity.
Jukos nyní těží necelý půl milion barelů denně a snaží se splatit zbývající dluhy. V roce 2004 skupina těžila asi 1,6 milionu barelů denně. Tržní hodnota Jukosu spadla o zhruba 90 procent, třebaže zbytek ruského ropného sektoru díky vysokým cenám ropy vzkvétal. Analytici považují její krach již jen za otázku času.