Náhradní doprava je zavedena na tratích Benešov - Tábor, Plzeň - Cheb, Plzeň - České Budějovice. Určitá omezení platí i pro trasu z Prahy do Benešova, ta by však podle Ondruje měla být v průběhu ranních hodin sjízdná.
Na trase z Brna do České Třebové probíhají práce na ukončení výluky v úseku Svitavy - Opatov. S určitými omezeními musí cestující počítat i v okolí Lysé nad Labem a Velkého Oseku.
Příměstská doprava na dalších tratích kolem Prahy a velkých měst na Moravě je zatím bez výraznějších omezení, podobná situace panuje i na hlavním tahu z Prahy do Olomouce a Ostravy.
Omezení jsou většinou způsobena odstraňováním stromů, které kvůli silnému větru napadaly na koleje.